More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3946 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3946  histidine kinase  100 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2292  histidine kinase  35.07 
 
 
309 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.924243  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0361  histidine kinase  29.93 
 
 
297 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2321  histidine kinase  30.2 
 
 
305 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1195  sensor histidine kinase  33.58 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000111756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1023  sensor histidine kinase  33.58 
 
 
301 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
459 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
469 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  30.97 
 
 
502 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  30.97 
 
 
481 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  33.91 
 
 
501 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
501 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
480 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
501 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  29.66 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  29.55 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0685  histidine kinase  33.65 
 
 
293 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
381 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  28.4 
 
 
502 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  29.55 
 
 
358 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
468 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  31.06 
 
 
610 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
608 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  30.64 
 
 
608 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  29.96 
 
 
360 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
815 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
407 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
381 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
331 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  30.25 
 
 
368 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  29.75 
 
 
368 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  29.6 
 
 
486 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  29.62 
 
 
482 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
583 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4364  histidine kinase  27.08 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  31.73 
 
 
583 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
608 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0591  sensor histidine kinase  26.25 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4661  sensor histidine kinase  26.25 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4662  sensor histidine kinase  26.25 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  26.21 
 
 
341 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4646  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  30.97 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4432  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4282  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4776  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4649  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  27.35 
 
 
694 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  29.29 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  25.58 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  27.24 
 
 
447 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4271  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.565244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  26.27 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  25.09 
 
 
355 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
375 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
609 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
484 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
384 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
484 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  29.47 
 
 
484 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  28.87 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  24.81 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  28.75 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  32.05 
 
 
900 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  30.1 
 
 
867 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
614 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
582 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  31.76 
 
 
389 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  28.69 
 
 
739 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  26.64 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  23.73 
 
 
375 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  26.64 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
484 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  26.64 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
484 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
572 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  26.23 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
619 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05740  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
405 aa  89.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
399 aa  89.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3232  histidine kinase  24.51 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  28.11 
 
 
385 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
611 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  24.03 
 
 
288 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.45 
 
 
613 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>