More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0560 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  100 
 
 		 341 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2147  histidine kinase  38.73 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1154  histidine kinase  36.28 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0538  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.77 
 
 		 486 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1537  histidine kinase  25.95 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.496885  normal  0.0588586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 		 568 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.76 
 
 		 481 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 525 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 695 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 902 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 608 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  30.43 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  27.99 
 
 		 885 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 510 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 466 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  25.9 
 
 		 526 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  29.02 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 718 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 701 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  28.44 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.64 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 584 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 621 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  28.64 
 
 		 910 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 885 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  26.88 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 890 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  29.22 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1842  histidine kinase  28.68 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  27.47 
 
 		 591 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 599 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 470 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 597 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 587 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  26.67 
 
 		 549 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 958 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 522 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 533 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 815 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  29.66 
 
 		 524 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.98 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.66 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1261 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 596 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 896 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 597 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 645 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 597 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12411  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  35.43 
 
 		 386 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  24.06 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 655 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  29.17 
 
 		 742 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 730 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  22.44 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  25.4 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>