More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05740  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
405 aa  811    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1630  histidine kinase  47.3 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392463  hitchhiker  0.000308423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  39.94 
 
 
377 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  41.41 
 
 
386 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  29.66 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  35.8 
 
 
481 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  33.44 
 
 
501 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  27.82 
 
 
502 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  38.34 
 
 
501 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  38.34 
 
 
501 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  37.85 
 
 
469 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  37.85 
 
 
501 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  37.85 
 
 
480 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
368 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  37.45 
 
 
501 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  37.45 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
368 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
368 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
368 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  36.65 
 
 
501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  36.65 
 
 
501 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  35.97 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  33.44 
 
 
368 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1834  histidine kinase  33.48 
 
 
348 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
381 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
361 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
375 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  29.77 
 
 
358 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
457 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
368 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
484 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
484 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
368 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
365 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
484 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
484 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  28.91 
 
 
375 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
484 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
484 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  28.91 
 
 
355 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  29.3 
 
 
291 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  31.7 
 
 
362 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  30.35 
 
 
288 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  31.01 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  32.13 
 
 
226 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
484 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.7 
 
 
1162 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  32.54 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  34.2 
 
 
479 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  27.34 
 
 
337 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
385 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  32 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
815 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  31.6 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  30.45 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
482 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
463 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  28.12 
 
 
291 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  30.1 
 
 
360 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
340 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
431 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  30.88 
 
 
337 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.59 
 
 
463 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
340 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.59 
 
 
463 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
314 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.59 
 
 
463 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  29.49 
 
 
486 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
340 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.5 
 
 
503 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
463 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
614 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  32.89 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  32.63 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  29.25 
 
 
389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
613 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
438 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>