More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0972 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  100 
 
 		 571 aa  1156    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  41.6 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  42.51 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  40.67 
 
 		 500 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  40.67 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  43.43 
 
 		 501 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  39.03 
 
 		 487 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  41.16 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 454 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  37.08 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  35.89 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  35.59 
 
 		 449 aa  134  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  26.56 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 902 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 885 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 		 1853 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 901 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  24.3 
 
 		 913 aa  70.5  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1847 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  25.6 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  24.32 
 
 		 595 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 		 1843 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.35 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.18 
 
 		 895 aa  67.4  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 891 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 875 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4132  histidine kinase  24.68 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 945 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  24.26 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  24.37 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 919 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 883 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  24.47 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  25.87 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.21 
 
 		 778 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.21 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  25.96 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  26.38 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.05 
 
 		 660 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 1155 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.21 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  26.38 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.21 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.21 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  23.24 
 
 		 903 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1433 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  26.38 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 365 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  25.96 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.24 
 
 		 778 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 708 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.24 
 
 		 778 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.24 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  27.39 
 
 		 501 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 777 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  25.96 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.18 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 880 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  23.97 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  22.42 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  24.14 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 		 950 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 		 1350 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.28 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.69 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 		 1137 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 		 925 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3226  bacterioferritin  23.48 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  24.36 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  25.42 
 
 		 1137 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  25.96 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 919 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>