139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16991 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  64.92 
 
 
463 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  64.18 
 
 
461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  63.74 
 
 
461 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  54.59 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  52.21 
 
 
455 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  34.1 
 
 
457 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  30.32 
 
 
500 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  30.53 
 
 
500 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  30.33 
 
 
501 aa  167  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  29.35 
 
 
496 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  31.98 
 
 
487 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  30.55 
 
 
500 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  35.89 
 
 
571 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
895 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
395 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  32.12 
 
 
730 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
594 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
604 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
551 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
394 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
887 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
887 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
610 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1088 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.89 
 
 
819 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 
766 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
379 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
379 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
319 aa  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1195  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
609 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.82 
 
 
778 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
819 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.82 
 
 
778 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  26.42 
 
 
1322 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
379 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 
1210 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 
1145 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  25.17 
 
 
1211 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  27.75 
 
 
555 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
901 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.41 
 
 
778 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  23.35 
 
 
932 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 
1075 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
905 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
369 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  25.52 
 
 
461 aa  47  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
760 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  28.67 
 
 
952 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
899 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  22.47 
 
 
932 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
483 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  26.05 
 
 
885 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 
2783 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
771 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  27.46 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  25.49 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  24.89 
 
 
587 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
907 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
801 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  26.28 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0355  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1853 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.11 
 
 
779 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
899 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  28.25 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  26.83 
 
 
905 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.69 
 
 
789 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  30.71 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  28.87 
 
 
735 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
608 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.61 
 
 
854 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
844 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
763 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.65 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
364 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
885 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 
893 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 
1792 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.0700818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  27.5 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.44 
 
 
778 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.44 
 
 
778 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 
504 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>