More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1517 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  100 
 
 		 457 aa  893    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  39.96 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  37.78 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  37.47 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  41.93 
 
 		 501 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  41.16 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  37.47 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  37.39 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 463 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  35.36 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  35.9 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  34.1 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 461 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 907 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 905 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 885 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28.16 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  25.97 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  28.71 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  28.4 
 
 		 646 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  28.12 
 
 		 504 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  26.7 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  28.76 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  26.55 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  25 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  24.69 
 
 		 1334 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  26.67 
 
 		 835 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 1352 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 628 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 905 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  28.57 
 
 		 910 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 902 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 522 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 538 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  22.97 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  21 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  27.15 
 
 		 667 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  26.34 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 663 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  25.22 
 
 		 845 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  24.52 
 
 		 913 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.36 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  25.11 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 945 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 581 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 654 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  24.92 
 
 		 905 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  26.2 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 907 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  23.11 
 
 		 571 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 902 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 		 687 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 965 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  27.1 
 
 		 1122 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 599 aa  53.9  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0366  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 936 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.977062  decreased coverage  0.000832087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 551 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 		 633 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 530 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>