More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0366 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0366  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 936 aa  1820    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.977062  decreased coverage  0.000832087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 817 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00572  putative signal transduction histidine kinase two-component system with Protein-glutamate methylesterase domain  28.82 
 
 		 919 aa  273  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  36.58 
 
 		 810 aa  258  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 780 aa  257  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.21 
 
 		 544 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1433 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  42.38 
 
 		 900 aa  254  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 789 aa  252  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 791 aa  250  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 784 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1127 aa  249  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  38.5 
 
 		 787 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 729 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 		 1157 aa  244  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 764 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1691 aa  244  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.56 
 
 		 923 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 662 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 717 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1313 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 1029 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 937 aa  239  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 1350 aa  239  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 957 aa  238  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1195 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 657 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 627 aa  237  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1768 aa  237  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 1068 aa  237  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 882 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 925 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  30.48 
 
 		 968 aa  235  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  33.47 
 
 		 800 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 950 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 969 aa  234  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1765 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 674 aa  234  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 1110 aa  234  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.95 
 
 		 661 aa  233  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1075 aa  233  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 589 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 801 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 785 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 		 1763 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.6 
 
 		 738 aa  233  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  34.42 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 973 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1550 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 579 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  33.91 
 
 		 736 aa  231  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 865 aa  231  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1407 aa  230  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1767 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1767 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 803 aa  230  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.11 
 
 		 1028 aa  230  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 921 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 847 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 868 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.97 
 
 		 777 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1397 aa  228  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 922 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 827 aa  228  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.57 
 
 		 1560 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  39.12 
 
 		 1885 aa  228  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  33.19 
 
 		 1000 aa  227  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1398 aa  227  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.02 
 
 		 1026 aa  227  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 947 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  42.75 
 
 		 1257 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 778 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 968 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  32.49 
 
 		 732 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  36.12 
 
 		 984 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1771 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  39.9 
 
 		 2109 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 916 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 871 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  34.96 
 
 		 803 aa  226  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1058 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1767 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.42 
 
 		 1765 aa  225  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  37.89 
 
 		 544 aa  225  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1322 aa  225  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 863 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  34.81 
 
 		 987 aa  224  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  35.34 
 
 		 1871 aa  224  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  39.19 
 
 		 698 aa  224  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.86 
 
 		 1023 aa  224  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  32.44 
 
 		 641 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 		 687 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 818 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 974 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1287 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 822 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 2051 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  33.41 
 
 		 845 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 1223 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>