192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  910    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  64.92 
 
 		 455 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  58.79 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  58.79 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  59.56 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  53.58 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 457 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  34.86 
 
 		 457 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  32.17 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  31.14 
 
 		 501 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  32.06 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  29.83 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  30.48 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  28.97 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  37.71 
 
 		 571 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  26.72 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3420  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74408  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1088 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 497 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.269832  normal  0.064704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 498 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  25.17 
 
 		 760 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 604 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  29.68 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  25.66 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1195  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 609 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0036  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 759 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.488776  normal  0.166978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.67 
 
 		 819 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.86 
 
 		 730 aa  50.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  19.44 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 878 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 905 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 610 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 1853 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  26.71 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  25.99 
 
 		 581 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5512  histidine kinase  25.76 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 885 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 2783 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  27.04 
 
 		 1364 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.43 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.29 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 887 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  24.86 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.43 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 901 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  24.86 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 887 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  22.17 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 807 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 801 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  22.82 
 
 		 248 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 581 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  26.81 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  22.17 
 
 		 458 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  22.17 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  25.43 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  25.43 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  22.43 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  25.43 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  24.78 
 
 		 581 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.43 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.43 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.12 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 901 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0355  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2000  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 482 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.84 
 
 		 653 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  22.17 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  25 
 
 		 621 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1075 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.29 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  22.17 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>