More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2520 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3420  sensor histidine kinase  94.57 
 
 		 497 aa  961    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74408  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.37 
 
 		 497 aa  971    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  1012    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.269832  normal  0.064704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.95 
 
 		 498 aa  890    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2003  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  62.58 
 
 		 497 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2000  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  63.68 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.37 
 
 		 486 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.55 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.0436072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3421  sensor histidine kinase  58.12 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29010  periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.89 
 
 		 423 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  34.78 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 422 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  32.76 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.81 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.18 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  27.6 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  27.9 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  27.9 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  27.32 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.06 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  27.62 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  31.89 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  30.99 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 671 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  33.48 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 855 aa  114  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 662 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 595 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 515 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.98 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 1519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.47 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 729 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  32.39 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  28.23 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.49 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 548 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 548 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  27.82 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  27.82 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  28.23 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.84 
 
 		 604 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  26.84 
 
 		 604 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  28.57 
 
 		 234 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  29.2 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 378 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 584 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  28.05 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  27.82 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  32.08 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  27.82 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  29.2 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  28.05 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.08 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 1527 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 498 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  29.66 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 1527 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  27.02 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  29.41 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.52 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2985  histidine kinase  31.3 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 699 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 586 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  33.76 
 
 		 612 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.8 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  33.76 
 
 		 693 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  31.25 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  27.6 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  32.73 
 
 		 676 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  32.58 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  28.32 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  31.65 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 674 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.05 
 
 		 579 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  28.32 
 
 		 465 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>