More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1320 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  100 
 
 
457 aa  935    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.48 
 
 
463 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
357 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  31.7 
 
 
357 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
455 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
455 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
493 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  35.85 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  32.68 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  32.68 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  34.52 
 
 
408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  32.68 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  32.71 
 
 
347 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
467 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.8 
 
 
472 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
425 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  29.1 
 
 
467 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
426 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.52 
 
 
1162 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  29.64 
 
 
357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
457 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.61 
 
 
512 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  32.41 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
471 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  32.18 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
473 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
639 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
354 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
641 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.12 
 
 
461 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  28.39 
 
 
604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  28.39 
 
 
604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.7 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.33 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  32.63 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.11 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.11 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.91 
 
 
518 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
518 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  31.44 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  28.1 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.42 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.26 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  31.09 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.06 
 
 
461 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  28.08 
 
 
603 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  28.08 
 
 
603 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
639 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.39 
 
 
455 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  29.23 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.01 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  33.7 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  25.59 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.71 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.61 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  31.41 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.71 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  31.39 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.4 
 
 
460 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.95 
 
 
473 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
535 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
487 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
458 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
484 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
487 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
468 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.76 
 
 
496 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  29.78 
 
 
481 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>