More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2634 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  869    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.22 
 
 
413 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.07 
 
 
426 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  64.03 
 
 
408 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  64.32 
 
 
408 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  59.41 
 
 
398 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.1 
 
 
427 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.4 
 
 
414 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
440 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  54.98 
 
 
431 aa  263  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  56.99 
 
 
496 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  52.31 
 
 
415 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.82 
 
 
414 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
410 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
536 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
469 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  30.54 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
428 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  36.23 
 
 
442 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
420 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
461 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  34.08 
 
 
536 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  38.21 
 
 
428 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
464 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
563 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
429 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  36.49 
 
 
538 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  36.8 
 
 
442 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  36.8 
 
 
442 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  36.8 
 
 
442 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
442 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
442 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
442 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
496 aa  143  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.9 
 
 
518 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.45 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  35.49 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  36.97 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
456 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
550 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  35.77 
 
 
469 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
535 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  33.23 
 
 
457 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  29.63 
 
 
422 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  33.8 
 
 
433 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  34.1 
 
 
453 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  33.8 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.19 
 
 
433 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  32.7 
 
 
439 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.75 
 
 
433 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.29 
 
 
447 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
422 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
422 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  30.04 
 
 
422 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
535 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  33.89 
 
 
561 aa  136  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  28.47 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  33.8 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
429 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
475 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.59 
 
 
449 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  33.45 
 
 
433 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  31.05 
 
 
449 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  35.27 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  35.11 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  33.22 
 
 
561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
449 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  26.44 
 
 
433 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  29.79 
 
 
425 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  31.71 
 
 
432 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.04 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  29.79 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  26.44 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  26.21 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  26.21 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
435 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>