159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1671 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 454 aa  921    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  91.41 
 
 		 454 aa  820    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  72.91 
 
 		 457 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  92.73 
 
 		 454 aa  826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  46.72 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  40.62 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  40.32 
 
 		 449 aa  345  8e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  28.6 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  26.92 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  26.92 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  27.94 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  31.25 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  34.19 
 
 		 500 aa  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  29.14 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  39.11 
 
 		 571 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  24.23 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 2153 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 895 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 608 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 650 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.03 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.03 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.53 
 
 		 934 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.51 
 
 		 599 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 555 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.41 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 673 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 801 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03200  bacteriophytochrome histidine kinase, putative  28.28 
 
 		 1871 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.796961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 2161 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0950  histidine kinase  26.39 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  26.19 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1149  histidine kinase  23.71 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19.23 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.23 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 899 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.74 
 
 		 340 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.86 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  21.82 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  23.18 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  23.24 
 
 		 676 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 905 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.56 
 
 		 1313 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 664 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 680 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 907 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  18.85 
 
 		 379 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  23.93 
 
 		 935 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 885 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 752 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.4 
 
 		 575 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 706 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 		 383 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  25.83 
 
 		 571 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  22.22 
 
 		 784 aa  46.6  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  25.48 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.08 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  24.5 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1390 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  25.83 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  25.42 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22 
 
 		 907 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1390 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.28 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  23.23 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.85 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.47 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 945 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4989  histidine kinase  23.84 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784849  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  25.49 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4364  histidine kinase  27.13 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4893  sporulation kinase  22 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1964 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  24.28 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1390 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.73 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  21.51 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.7 
 
 		 1274 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>