More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3736 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  100 
 
 		 500 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  99.2 
 
 		 500 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  54.72 
 
 		 496 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  46.01 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  44.67 
 
 		 501 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  40.52 
 
 		 571 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  39.76 
 
 		 487 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  37.47 
 
 		 457 aa  240  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  30.53 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  31.02 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  29.2 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 454 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 1271 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 899 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 1843 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  27.64 
 
 		 356 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 608 aa  66.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  25.91 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 		 2783 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 		 1853 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  28.26 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1479 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 1303 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4132  histidine kinase  21.37 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  21.37 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  28.7 
 
 		 910 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.21 
 
 		 923 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.51 
 
 		 904 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 945 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.51 
 
 		 914 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 899 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  23.98 
 
 		 581 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 1977 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.31 
 
 		 766 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.51 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 		 1847 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 1433 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  24.19 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  24.35 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 608 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  24.54 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.89 
 
 		 1127 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  26.36 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.09 
 
 		 904 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 901 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  28.09 
 
 		 914 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 899 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.09 
 
 		 914 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  28.09 
 
 		 914 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.09 
 
 		 914 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.37 
 
 		 823 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1965 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.9 
 
 		 1070 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1363 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 		 1159 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 1406 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  23.87 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.88 
 
 		 744 aa  60.1  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  24.03 
 
 		 918 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  21.96 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  24.68 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  24.68 
 
 		 855 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.32 
 
 		 1334 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.95 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  26.01 
 
 		 1141 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  22.98 
 
 		 549 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.19 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.03 
 
 		 1267 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.26 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.31 
 
 		 1155 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 916 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>