216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 426 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  53.95 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  39.11 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  36.78 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  29.58 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  29.32 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  30.57 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  28.83 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  28.57 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  28.57 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  28.57 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  28.57 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  28.94 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  30.15 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  29.49 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  32.2 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  24.68 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  27.07 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.97 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.05 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  23.92 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.88 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  27.71 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  23.69 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  26.32 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  23.76 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  25.42 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.82 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.61 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  21.39 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.61 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.37 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  31.96 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  22.61 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  26.38 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.31 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.78 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  22.12 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.93 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  19.95 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  24.81 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  23.05 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  30.69 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.59 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  24.25 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  23.2 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.73 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  23.48 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  28.64 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  24.18 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  20.49 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  21.57 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  22.15 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  20.49 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  21.83 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  20.08 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  25 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  22.82 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.7 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.57 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  20.49 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  23.82 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.84 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  25.83 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  22.26 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  27.83 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  31.18 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  29.57 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  23.77 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.03 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  23.83 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  22.56 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  22.1 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  27.34 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.41 
 
 		 605 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.71 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  28.41 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  24.38 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  22.56 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  30.83 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  28.69 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  22.1 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  23.19 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  30.69 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.14 
 
 		 673 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  24.36 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.46 
 
 		 381 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.94 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.43 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.91 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.32 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>