More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6132 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  100 
 
 		 422 aa  879    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  42.03 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  35.8 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  34.1 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  29.64 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  25.12 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  23.63 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.24 
 
 		 880 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  28.52 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.48 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  27.52 
 
 		 460 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  24.59 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  24.24 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  23.83 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  23.74 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.99 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.77 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  24.07 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.94 
 
 		 896 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.56 
 
 		 394 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.34 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.77 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  25.28 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.75 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  22.83 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.59 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.23 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  27.19 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  24.68 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  23.56 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  30.36 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.76 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  22.78 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.53 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.12 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.55 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.5 
 
 		 393 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  27.47 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.79 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.6 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.27 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  23.91 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  25.3 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  23.31 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.91 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  31.53 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  21.76 
 
 		 381 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  24.25 
 
 		 879 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.22 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  24.41 
 
 		 423 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.32 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  29.26 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.26 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.33 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.2 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.83 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  23.68 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  24.69 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.37 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  22.41 
 
 		 878 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.67 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  24.82 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  24.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.13 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.32 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.51 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  24.82 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.37 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  22.91 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  24.39 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.06 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.64 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.08 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.3 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  24.88 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.88 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  24.88 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  24 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  24.04 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  24.64 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.45 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  24.64 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.01 
 
 		 395 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  30.37 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.96 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.08 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>