More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1295 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  100 
 
 		 430 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.17 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.28 
 
 		 406 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.5 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  40.35 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.03 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.03 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.03 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.28 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.03 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  43.14 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.28 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.28 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.69 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.28 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 644 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  39.85 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  42.43 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.57 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  42.36 
 
 		 420 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.93 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.17 
 
 		 412 aa  305  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.45 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  40 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.18 
 
 		 662 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  40.51 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.29 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.35 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.09 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.35 
 
 		 405 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.93 
 
 		 657 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  41.65 
 
 		 405 aa  299  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 678 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  42.68 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.51 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.55 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 423 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.26 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.72 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  38.9 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.6 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.61 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.63 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.39 
 
 		 572 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.37 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  40.19 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.65 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.65 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.45 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  40.3 
 
 		 420 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.1 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  40.14 
 
 		 604 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  40.14 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.12 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.85 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.6 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  40.3 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.29 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  39.41 
 
 		 414 aa  289  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.29 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.65 
 
 		 641 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.28 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.29 
 
 		 406 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.21 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.89 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  40.45 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 414 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.41 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  37.44 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.35 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 		 414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  39.23 
 
 		 661 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  39.29 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.95 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.44 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  39.75 
 
 		 878 aa  285  8e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.36 
 
 		 415 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  39.95 
 
 		 416 aa  285  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.44 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 672 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.21 
 
 		 674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.7 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.95 
 
 		 679 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.81 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  39.26 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.1 
 
 		 673 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.6 
 
 		 605 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  41.6 
 
 		 880 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>