More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  97.89 
 
 		 427 aa  861    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  100 
 
 		 427 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  64.57 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  63.06 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  61.01 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  62 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  63.08 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  62.97 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  61.27 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  43.16 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  27.34 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.49 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.54 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  26.14 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  27.34 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.07 
 
 		 422 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  29.83 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.65 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  24.7 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  26.14 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  25.56 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.06 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  23.14 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.56 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  26.57 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.15 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.84 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25.06 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.23 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.47 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.47 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.55 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  24.2 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  24.53 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  25.08 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  24.52 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  25.08 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.93 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.11 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.71 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.46 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  25.71 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  27.65 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.55 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.09 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.6 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  22.64 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.96 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.79 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.19 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  23.38 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  24.11 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.21 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  24.21 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.21 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  24.21 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  23.06 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  23.96 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  23.96 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  23.96 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  23.96 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  23.59 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.15 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  23.2 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  24.83 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.33 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  25.1 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25.6 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  23.63 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.47 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.32 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  22.66 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  22.56 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  22.52 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.26 
 
 		 880 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  22.54 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  22.25 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.38 
 
 		 885 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  29.46 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.2 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  25.3 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  27.91 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  23.24 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.02 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.66 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  24.14 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.78 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.2 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.44 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  25.3 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  22.17 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>