More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1124 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  88.39 
 
 		 495 aa  882    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  100 
 
 		 488 aa  1015    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  36.74 
 
 		 461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  34.76 
 
 		 476 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  34.99 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  37.55 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  34.65 
 
 		 460 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  32.53 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.29 
 
 		 389 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.79 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  23.9 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.69 
 
 		 401 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  25.57 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  24.25 
 
 		 374 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  24.67 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  22.67 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  25.5 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  25.5 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  26.05 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  25.5 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  26.12 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  27.9 
 
 		 392 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  27.25 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  23.92 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  25.17 
 
 		 385 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  23.53 
 
 		 395 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  27.04 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  23.83 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  23.4 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.24 
 
 		 438 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  23.83 
 
 		 395 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  21.98 
 
 		 422 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  23 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.17 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  21.72 
 
 		 684 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  24.08 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  28.63 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.43 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  25 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.2 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  24.09 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  24.15 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  23.66 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  29.61 
 
 		 384 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  24.83 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.19 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  23.03 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.24 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  22.58 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  22.59 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  25.31 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  24.89 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  24.67 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  21.31 
 
 		 368 aa  76.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.21 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  21.28 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  24 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  21.92 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  22.59 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  22.9 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  26.52 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  23.03 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  25.48 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  21.91 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  21.83 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.88 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.2 
 
 		 879 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  19.79 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  25.75 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.06 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  21.45 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  21.53 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  22.69 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  23.2 
 
 		 878 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 380 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  25.4 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  23.81 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  25.85 
 
 		 391 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  23.02 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.52 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  23.68 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.36 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  24.58 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  28.05 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  21.19 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  23.4 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.69 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  24.1 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>