More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2941 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  100 
 
 		 384 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  56.12 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  44.79 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  38.78 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  40.57 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  36.39 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  36.13 
 
 		 464 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  36.13 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  36.13 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  36.13 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  35.86 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.53 
 
 		 470 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  29.13 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.98 
 
 		 421 aa  145  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 684 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  25.53 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.73 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  28.57 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.53 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.88 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.68 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  30.38 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  30.17 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  30.38 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.22 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.46 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  24.02 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  31.11 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  27.62 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  25.3 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  29.11 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  31 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 462 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  29.44 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.45 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.64 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  25.29 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  24.4 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  24.2 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  24.3 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  24.03 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.36 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.31 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.8 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.31 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  22.66 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.19 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.75 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.41 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.68 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.78 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.11 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  27.39 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.94 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.17 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.28 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  21.04 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.6 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.46 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.47 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  28.5 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  27.16 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.14 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  30.11 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  23.64 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  26.69 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.46 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  25.88 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.14 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  22.16 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.08 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  27.35 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  25.97 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.02 
 
 		 432 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  25.97 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  25.21 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  24.58 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  23.55 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25.21 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  34.21 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  22.68 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.8 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.93 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  29.11 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.45 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.22 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.3 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.24 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  24.06 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>