More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2417 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  99.74 
 
 		 385 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  100 
 
 		 385 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  99.74 
 
 		 385 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  99.74 
 
 		 464 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  99.22 
 
 		 385 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  99.74 
 
 		 385 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  47.59 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  47.94 
 
 		 388 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  48.72 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  38.24 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  35.86 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  33.94 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  34.72 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  35.19 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  32.31 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  33.59 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  28.68 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  29.77 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  26.28 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.27 
 
 		 437 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.52 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  25.75 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.1 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 684 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  30.96 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.42 
 
 		 476 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  25.85 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.92 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  25.99 
 
 		 462 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  28.45 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  26.81 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  22.41 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.89 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  29.06 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  28.87 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.53 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.67 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  24.26 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.5 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.07 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.49 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.3 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.8 
 
 		 885 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.29 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.25 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.62 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  26.98 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.12 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 433 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  23.76 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.99 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.62 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.25 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.22 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  28.4 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  26.43 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.63 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.94 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.34 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  22.71 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.6 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.91 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.56 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  25.94 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.49 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.34 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.38 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.98 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.98 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.96 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  26.63 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  22.44 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.91 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.4 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.49 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.91 
 
 		 413 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.45 
 
 		 404 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.05 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  23.94 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  28.33 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.79 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.95 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  22.91 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.1 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.23 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  22.91 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.31 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.44 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.36 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.77 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  22.45 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.68 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  27.1 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>