More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3297 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  100 
 
 
393 aa  804    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  53.33 
 
 
394 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  51.79 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.18 
 
 
394 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.09 
 
 
411 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34 
 
 
418 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.3 
 
 
393 aa  219  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  31.03 
 
 
392 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.15 
 
 
428 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  34.68 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.38 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.38 
 
 
419 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  36.36 
 
 
434 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.38 
 
 
406 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.57 
 
 
394 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  33.67 
 
 
401 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.01 
 
 
414 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.48 
 
 
406 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.48 
 
 
406 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.48 
 
 
406 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.48 
 
 
406 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.23 
 
 
406 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.93 
 
 
425 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.23 
 
 
406 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 
433 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.23 
 
 
406 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.23 
 
 
406 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  35.68 
 
 
408 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.04 
 
 
406 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.83 
 
 
393 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.51 
 
 
406 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.65 
 
 
417 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.51 
 
 
406 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33 
 
 
414 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  34.29 
 
 
419 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.34 
 
 
420 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.28 
 
 
406 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.36 
 
 
412 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.51 
 
 
406 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.51 
 
 
406 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  31.72 
 
 
424 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.76 
 
 
406 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.74 
 
 
896 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.98 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  33.41 
 
 
421 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.69 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.69 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  33.94 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.39 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  33.33 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  34.02 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.75 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.51 
 
 
407 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  33.24 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  33.24 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.98 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  35.97 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.24 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.08 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  33.59 
 
 
420 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.22 
 
 
413 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  32.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.9 
 
 
412 aa  199  7e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.98 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.25 
 
 
407 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.59 
 
 
429 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.59 
 
 
429 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.59 
 
 
421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.16 
 
 
420 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.14 
 
 
443 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.93 
 
 
429 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  32.49 
 
 
416 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.11 
 
 
409 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.5 
 
 
395 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.4 
 
 
412 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.22 
 
 
444 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.75 
 
 
406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 
406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.42 
 
 
441 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.93 
 
 
407 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  34.49 
 
 
414 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  34.49 
 
 
414 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  32.82 
 
 
423 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.81 
 
 
413 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.41 
 
 
414 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.18 
 
 
885 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.68 
 
 
408 aa  193  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  32.22 
 
 
419 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.15 
 
 
879 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  33.25 
 
 
420 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  31.77 
 
 
420 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.89 
 
 
426 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.63 
 
 
414 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  35.16 
 
 
428 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.86 
 
 
408 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.98 
 
 
449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  31.88 
 
 
406 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>