62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46105 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  100 
 
 		 485 aa  999    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  30.73 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  28.44 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  29.88 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  29.09 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  28.67 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  25.54 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  29.81 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  25.19 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  25.87 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  28.88 
 
 		 390 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  26.32 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.32 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.32 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.32 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  26.56 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 684 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  28.4 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  28.25 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  27.7 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  22.92 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.03 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  23.85 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.36 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  22.69 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  26.38 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  26.09 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.22 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  25 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  28.27 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.57 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  27.04 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  25.36 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  22.69 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  26.58 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  20.86 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  21.13 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.97 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  21.6 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  25.41 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  21.51 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  20.68 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  22.13 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  20.71 
 
 		 382 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.22 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  36.11 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  22.78 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  23.04 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.53 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  24.42 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  23.85 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00583  hypothetical protein  20.45 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  36.23 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.1 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0961  aminotransferase class V  40.38 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  20.88 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  20.92 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>