More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4279 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  100 
 
 		 462 aa  974    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  68.83 
 
 		 461 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  55.7 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  54.84 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  37.92 
 
 		 495 aa  279  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  37.55 
 
 		 488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  29.62 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  29.51 
 
 		 455 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.03 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.18 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.51 
 
 		 404 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.15 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  26.14 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.37 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  26.14 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  31.54 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  29.91 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  31.4 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.21 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.2 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  32.05 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  27.92 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.9 
 
 		 379 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.23 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  25.12 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.23 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.23 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  28.51 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  27.42 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  25.98 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  29.91 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  25.31 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.4 
 
 		 287 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.28 
 
 		 401 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  29.96 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  28.63 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  24.72 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.79 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  25.35 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  28.31 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  25.48 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.03 
 
 		 393 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  28.07 
 
 		 391 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.45 
 
 		 387 aa  96.7  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  27.59 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.32 
 
 		 392 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  22.57 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  27.54 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  28.07 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  25.69 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.13 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.88 
 
 		 406 aa  93.2  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  22.8 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  23.04 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  24.59 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  23.33 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.56 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  27.44 
 
 		 363 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.08 
 
 		 409 aa  90.5  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  23.54 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.16 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.69 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.27 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.25 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  23.46 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.91 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  23.36 
 
 		 393 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  24.5 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  27.17 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  25.69 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.86 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  23.32 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  25.65 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.88 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  22.99 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.25 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.47 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.47 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.85 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  24.44 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  24.85 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  21.98 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.17 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.27 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.8 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  22.9 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.9 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.65 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  24.19 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  22.74 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.23 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  25.51 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  31.33 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.42 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>