More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001209 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  85.65 
 
 		 476 aa  855    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  100 
 
 		 469 aa  989    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  54.64 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  54.84 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  34.94 
 
 		 495 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  31 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 455 aa  160  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  25 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  26.4 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  26.14 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.36 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  31.58 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  21.38 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25.55 
 
 		 395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  28.94 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  28.51 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.05 
 
 		 404 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  29.14 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.14 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.3 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  29.49 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  26.99 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  22.46 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  28.87 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  26.33 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  25.28 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.94 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  25.33 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  29.1 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.3 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  28.54 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  31.7 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  30.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  30.38 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  23.84 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  31.38 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  31.38 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  31.38 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  30.21 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  29.88 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.87 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  28.75 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  30.96 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  22.73 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  36.81 
 
 		 387 aa  99.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 684 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.21 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.74 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  27.41 
 
 		 384 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  24.81 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.18 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  22.54 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.71 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  25.52 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  30.12 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.69 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  24.69 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.04 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.33 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  26.14 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  25.6 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  33.14 
 
 		 395 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  33.54 
 
 		 394 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  25.4 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.33 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.22 
 
 		 377 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  24.94 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.45 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.93 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  25 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.65 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  24.67 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  23.8 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  31.06 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  29.75 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.53 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  30.7 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.95 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  28.21 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.21 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.98 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.48 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.75 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  26.32 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.27 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>