More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1219 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
384 aa  788    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  49.87 
 
 
388 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  50.93 
 
 
381 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  49.87 
 
 
382 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  51.98 
 
 
379 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  47.76 
 
 
380 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  49.07 
 
 
382 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  46.68 
 
 
385 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  48.68 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  46.17 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  45.87 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  41.36 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  44.89 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  43.27 
 
 
381 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  44.24 
 
 
381 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  44.16 
 
 
400 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  44.27 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  44.21 
 
 
378 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  44.09 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  47.22 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  44.06 
 
 
385 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  43.62 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  43.73 
 
 
380 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  41.84 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  41.88 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  40.63 
 
 
386 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  40.63 
 
 
386 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  42.59 
 
 
383 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  42.41 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  40.94 
 
 
380 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  40.16 
 
 
381 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  41.96 
 
 
379 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  38.46 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  39.27 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  38.58 
 
 
382 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  41.21 
 
 
388 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.17 
 
 
376 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  36.39 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  38.44 
 
 
413 aa  242  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.37 
 
 
390 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  34.65 
 
 
383 aa  212  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  34.74 
 
 
386 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.6 
 
 
393 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
392 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.29 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.77 
 
 
885 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.81 
 
 
879 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  31.22 
 
 
376 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.65 
 
 
412 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.95 
 
 
412 aa  179  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.2 
 
 
393 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.24 
 
 
880 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  33.42 
 
 
896 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.51 
 
 
878 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.57 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.07 
 
 
419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.06 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.06 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  32.21 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.88 
 
 
406 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  31.81 
 
 
406 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  31.81 
 
 
406 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  31.81 
 
 
406 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
406 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.61 
 
 
406 aa  170  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
406 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
406 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.55 
 
 
406 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.56 
 
 
420 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.59 
 
 
406 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.46 
 
 
404 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
373 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.76 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.26 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.3 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.57 
 
 
420 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.62 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.03 
 
 
420 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  33.04 
 
 
405 aa  162  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  31.3 
 
 
420 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  30.28 
 
 
416 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  31.62 
 
 
423 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.5 
 
 
408 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.66 
 
 
417 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.18 
 
 
414 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.28 
 
 
416 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.66 
 
 
406 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.66 
 
 
406 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.75 
 
 
449 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  31.61 
 
 
412 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  30.65 
 
 
381 aa  157  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.07 
 
 
417 aa  157  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>