More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2313 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 380 aa  771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  66.49 
 
 		 381 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  62.11 
 
 		 380 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  62.37 
 
 		 380 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  67.2 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  55.61 
 
 		 385 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  56.05 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  54.86 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  51.59 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  53.42 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  48.02 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  52.63 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  49.6 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  50.4 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  49.6 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  46.54 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  48.01 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  46.3 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  43.19 
 
 		 386 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  51.8 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  42.93 
 
 		 386 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  43.47 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  44.68 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  46.97 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  45.87 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  43.83 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  42.26 
 
 		 380 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  42.22 
 
 		 398 aa  299  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  38.95 
 
 		 381 aa  299  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  42.06 
 
 		 413 aa  289  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  43.17 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  41.01 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  39.52 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  42.04 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  37.73 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  36.24 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  39.26 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  35.47 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  37.04 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  38.36 
 
 		 879 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.18 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.09 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 896 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  37.5 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  33.86 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.02 
 
 		 885 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  36.13 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.62 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.26 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 878 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.11 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.99 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 880 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.46 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.32 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33.93 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.03 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.01 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  33.25 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.65 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.42 
 
 		 449 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.36 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.54 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.68 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.02 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.05 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.89 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  31.28 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.55 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.71 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.7 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.55 
 
 		 417 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.46 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.31 
 
 		 572 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.2 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.69 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.93 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  31.5 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  31.89 
 
 		 423 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.81 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.81 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.81 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.35 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  32.81 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.81 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.81 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.69 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  34.64 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>