More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0304 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  100 
 
 		 381 aa  777    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  46.84 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  50.26 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  46.17 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  44.06 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  48.42 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  46.79 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  47.88 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  45.65 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  46.6 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  46.97 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  46.03 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  48.67 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  46.72 
 
 		 385 aa  328  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  44.68 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  46.35 
 
 		 385 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  44.24 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  41.01 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  41.58 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  45.12 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  38.58 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  44.21 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.58 
 
 		 386 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  47.93 
 
 		 383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  43.09 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  42.97 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  39.01 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  37.17 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  42.52 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  39.11 
 
 		 380 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.38 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.73 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  38.27 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  38.54 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  40.87 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  40 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.96 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  39.72 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  38.6 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  34.56 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  37.4 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  34.37 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.68 
 
 		 885 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.95 
 
 		 879 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.03 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.11 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.9 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.4 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.05 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.48 
 
 		 880 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 896 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  34.21 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.41 
 
 		 414 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.19 
 
 		 878 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.55 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.98 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.64 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.65 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.9 
 
 		 674 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2430  Cysteine desulfurase  31.2 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0300543  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.43 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.9 
 
 		 672 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 664 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.5 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.49 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.9 
 
 		 673 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  33.07 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.78 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.97 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.47 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.15 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.81 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  32.9 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.84 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  34.46 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.61 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.37 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  32.9 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  30.37 
 
 		 414 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30.91 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  31.01 
 
 		 423 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.83 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.81 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.57 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.64 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.85 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>