More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0028 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  100 
 
 
380 aa  791    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  42.26 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  41.27 
 
 
380 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  41.42 
 
 
380 aa  295  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  41.32 
 
 
381 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  41.67 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  41.03 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  39.31 
 
 
381 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  40.74 
 
 
381 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  41.01 
 
 
380 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  40.94 
 
 
384 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  38.38 
 
 
381 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  39.11 
 
 
381 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  37.37 
 
 
382 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  39.26 
 
 
382 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  40.74 
 
 
380 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  39.74 
 
 
383 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  39.11 
 
 
381 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  36.98 
 
 
400 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  37.8 
 
 
387 aa  256  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  34.74 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.55 
 
 
385 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  36.05 
 
 
385 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  34.99 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  36.68 
 
 
378 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 
379 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  35.4 
 
 
380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  35.87 
 
 
413 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  34.65 
 
 
379 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  35.57 
 
 
388 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  33.86 
 
 
380 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  33.5 
 
 
392 aa  223  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  35.96 
 
 
383 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  31.69 
 
 
398 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  31.05 
 
 
386 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  31.05 
 
 
386 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  35.23 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  32.81 
 
 
376 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  32.2 
 
 
388 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  32.47 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  35.58 
 
 
878 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.9 
 
 
879 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  30.45 
 
 
378 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
383 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
412 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.39 
 
 
420 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.26 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.9 
 
 
885 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  29.11 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  32.48 
 
 
417 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.33 
 
 
415 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.93 
 
 
419 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  31.09 
 
 
405 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.71 
 
 
414 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.9 
 
 
420 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.55 
 
 
425 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.67 
 
 
419 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 
405 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  31.18 
 
 
408 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.77 
 
 
392 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.33 
 
 
403 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  29.11 
 
 
404 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.46 
 
 
420 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  31.03 
 
 
416 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.52 
 
 
435 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.15 
 
 
421 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  30.89 
 
 
394 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.03 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.28 
 
 
408 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.31 
 
 
412 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  30.37 
 
 
393 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.33 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  31.27 
 
 
395 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.46 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  32.42 
 
 
419 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.24 
 
 
416 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  30.26 
 
 
405 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 
412 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.33 
 
 
403 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.94 
 
 
403 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.23 
 
 
406 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  29.27 
 
 
404 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30.39 
 
 
880 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.57 
 
 
414 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.57 
 
 
414 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.23 
 
 
404 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  30.65 
 
 
393 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.55 
 
 
433 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.2 
 
 
417 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  29.95 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.7 
 
 
418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.83 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  28.31 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.39 
 
 
644 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.61 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  29.67 
 
 
423 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 
408 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.8 
 
 
413 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.31 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>