More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 380 aa  770    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  66.76 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  52.89 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  48.03 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  46.8 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  43.54 
 
 		 380 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  43.98 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 376 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  44.33 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  41.84 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  42.51 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  39.95 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  40.21 
 
 		 388 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  40.98 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  38.79 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  38.62 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  39.79 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  39.73 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  39.15 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  37.73 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  39.36 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  35.88 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  35.88 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  39.05 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  36.48 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  38.83 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  40.11 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  38.32 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.54 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  39.1 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  40.11 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  40.26 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  40.16 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  37.63 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.51 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  35.37 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  38.12 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  33.86 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.96 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.77 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  33.93 
 
 		 896 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  36.72 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  33.59 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  32.28 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.51 
 
 		 885 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 880 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 879 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 878 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.3 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.28 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.96 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.55 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.41 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  34.18 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.29 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.77 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.33 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.59 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.11 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.7 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.28 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  31.19 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.65 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  30.39 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  30.79 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.87 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  31.32 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30.63 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  31.23 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  30.63 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 644 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.02 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.04 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  32.18 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  30.37 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  30.37 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.43 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.37 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.05 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>