More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2316 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
383 aa  773    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  61.17 
 
 
385 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  57.56 
 
 
381 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  56.05 
 
 
380 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  52.63 
 
 
380 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  55 
 
 
380 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  51.71 
 
 
380 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  48.94 
 
 
380 aa  388  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  49.6 
 
 
381 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  47.87 
 
 
382 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  47.88 
 
 
381 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  51.04 
 
 
385 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  46.7 
 
 
382 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  50.93 
 
 
400 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  47.64 
 
 
381 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  45.33 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  46.58 
 
 
383 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  46.3 
 
 
385 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  43.28 
 
 
379 aa  319  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  44.47 
 
 
381 aa  318  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  39.63 
 
 
386 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  44.12 
 
 
381 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  42.44 
 
 
378 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  38.42 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  48.2 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  42.59 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  45.78 
 
 
379 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  41.93 
 
 
392 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  40.16 
 
 
380 aa  285  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  45.4 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  39.74 
 
 
380 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  40.11 
 
 
380 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  39.74 
 
 
388 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  37.08 
 
 
382 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  37.53 
 
 
398 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  41.62 
 
 
387 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  37.2 
 
 
392 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.76 
 
 
390 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  37.47 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  33.6 
 
 
378 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.11 
 
 
376 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.47 
 
 
393 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.92 
 
 
386 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  37.63 
 
 
393 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  37.56 
 
 
383 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  35.08 
 
 
393 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.32 
 
 
412 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.92 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.51 
 
 
885 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.04 
 
 
879 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.43 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.91 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.38 
 
 
406 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.26 
 
 
896 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.08 
 
 
414 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  35.25 
 
 
403 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.6 
 
 
412 aa  193  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  33.86 
 
 
376 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.22 
 
 
412 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.6 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  31.87 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.19 
 
 
409 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.17 
 
 
880 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  31.87 
 
 
406 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  34.11 
 
 
420 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  31.87 
 
 
406 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  31.87 
 
 
406 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  31.87 
 
 
406 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.87 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.87 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.87 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.87 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  34.2 
 
 
423 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.29 
 
 
433 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.81 
 
 
406 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.86 
 
 
419 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.59 
 
 
419 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  33.68 
 
 
410 aa  186  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.46 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  34.38 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.5 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.25 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  34.83 
 
 
878 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.75 
 
 
406 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.02 
 
 
414 aa  183  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.52 
 
 
415 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
420 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  33.77 
 
 
430 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.07 
 
 
420 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35 
 
 
412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.02 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.25 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  32.28 
 
 
414 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.25 
 
 
414 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.78 
 
 
408 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.82 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.72 
 
 
404 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  32.02 
 
 
414 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  33.33 
 
 
405 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>