More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0255 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  100 
 
 
386 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  56.74 
 
 
388 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  53.72 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  48.02 
 
 
390 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  38.32 
 
 
381 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  36.94 
 
 
381 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.83 
 
 
398 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  36.65 
 
 
386 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  36.39 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  36.34 
 
 
382 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  39.58 
 
 
383 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  35.49 
 
 
385 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  34.12 
 
 
382 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  36.03 
 
 
381 aa  239  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  34.63 
 
 
380 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  35.45 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  35.14 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  35.96 
 
 
380 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  37.17 
 
 
379 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  37.92 
 
 
382 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  35.4 
 
 
380 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  35.92 
 
 
381 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.88 
 
 
385 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  35.14 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  36.39 
 
 
392 aa  223  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  34.92 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  35.09 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  34.66 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  34.63 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  34.39 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  34.29 
 
 
400 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  35.26 
 
 
380 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  34.83 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  34.12 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  35.7 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  35.75 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  33.97 
 
 
379 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  32.9 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  35.04 
 
 
413 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  33.16 
 
 
388 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  31.75 
 
 
392 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  32.81 
 
 
376 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.07 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  33.6 
 
 
393 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  30.81 
 
 
378 aa  176  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  32.02 
 
 
376 aa  170  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.7 
 
 
412 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  31.01 
 
 
410 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  30.03 
 
 
394 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.72 
 
 
406 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.23 
 
 
885 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  30.31 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  31.25 
 
 
878 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.66 
 
 
413 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.31 
 
 
414 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.47 
 
 
880 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.56 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  30.91 
 
 
393 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.27 
 
 
413 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.44 
 
 
394 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  29.64 
 
 
410 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.93 
 
 
408 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  30.65 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.65 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  29.07 
 
 
424 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.46 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.01 
 
 
413 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.01 
 
 
413 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.76 
 
 
406 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  28.87 
 
 
404 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.17 
 
 
421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.97 
 
 
406 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.78 
 
 
406 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 
404 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.6 
 
 
418 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  28.97 
 
 
406 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 
406 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.18 
 
 
429 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  29.2 
 
 
420 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 
406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 
406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  28.05 
 
 
395 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.79 
 
 
393 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.27 
 
 
879 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.9 
 
 
896 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.61 
 
 
410 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.25 
 
 
406 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.25 
 
 
406 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.25 
 
 
406 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.25 
 
 
406 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.9 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  27.91 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.49 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.8 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>