More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2291 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  94.99 
 
 		 380 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 380 aa  757    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  62.11 
 
 		 380 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  60.21 
 
 		 381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  62.86 
 
 		 380 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  55.5 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  54.28 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  51.71 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  46.83 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  51.3 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  48.66 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  45.77 
 
 		 382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  47.62 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  47.76 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  45.21 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  47.88 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  43.65 
 
 		 385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  41.64 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  44.15 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  50.42 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  38.48 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.22 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  41.91 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  44.21 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  43.62 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  42.59 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  41.27 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  41.42 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  39.47 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  36.58 
 
 		 381 aa  275  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  43.32 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  38.83 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  41.27 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  35.9 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  36.55 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  37.96 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.77 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.02 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.26 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.26 
 
 		 879 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  36.77 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  36.91 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.48 
 
 		 896 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.68 
 
 		 878 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  36.03 
 
 		 880 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.48 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.03 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.03 
 
 		 406 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  34.47 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.29 
 
 		 885 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.22 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  35.77 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.57 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.48 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 		 442 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.22 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.16 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.9 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.93 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.5 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.16 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.89 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.36 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.16 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  29.31 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.11 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.41 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  32.58 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  31.85 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.84 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.81 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.9 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.64 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  31.58 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.59 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.59 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.59 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.56 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.59 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  32.4 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.64 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.73 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.72 
 
 		 429 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.59 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.07 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  29.77 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.46 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>