More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1729 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 385 aa  781    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  60.26 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  52.63 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  52.79 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  52.23 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  51.3 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  49.09 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  47.63 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  51.04 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  50.13 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  46.84 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  48.02 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  50 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  52.07 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  45.67 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  46.19 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  46.35 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  44.59 
 
 		 385 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  43.01 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  43.16 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  43.83 
 
 		 384 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  42.63 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  41.95 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  41.41 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  37.17 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  36.91 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  39.74 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  36.48 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.02 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  36.55 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  42.59 
 
 		 413 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  42.28 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.96 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  38.12 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  36.69 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  35.77 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.86 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  32.46 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.94 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.94 
 
 		 879 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.94 
 
 		 896 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.01 
 
 		 885 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  35.58 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 878 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  36.68 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  33.6 
 
 		 376 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.47 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.59 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.87 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.73 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 378 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.77 
 
 		 412 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.49 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.61 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  33.42 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 880 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  31.35 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.89 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.04 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.04 
 
 		 419 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.25 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.75 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  33.68 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.47 
 
 		 410 aa  192  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.34 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.08 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.64 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.55 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.02 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  34.23 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.06 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 394 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.85 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.03 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.03 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.11 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.03 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  31.51 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.03 
 
 		 406 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.03 
 
 		 406 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.43 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.51 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  34.21 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.28 
 
 		 420 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>