More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1751 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  100 
 
 
376 aa  772    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2430  Cysteine desulfurase  37.07 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0300543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  37.23 
 
 
381 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  37.4 
 
 
381 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  35.26 
 
 
383 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  36.17 
 
 
381 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  36.65 
 
 
388 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  33.86 
 
 
380 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  32.55 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  36.32 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  33.78 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  33.42 
 
 
382 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  32.8 
 
 
382 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  31.55 
 
 
380 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  31.32 
 
 
386 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  32.18 
 
 
379 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  31.32 
 
 
386 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  34.46 
 
 
400 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  33.78 
 
 
385 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  36.05 
 
 
380 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  30.05 
 
 
381 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  36.41 
 
 
379 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  36.91 
 
 
380 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  30.16 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.68 
 
 
385 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  35.4 
 
 
388 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  33.68 
 
 
381 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  29.63 
 
 
381 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  36.8 
 
 
383 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  31.22 
 
 
384 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  32.28 
 
 
380 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  33.16 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  29.95 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  33.86 
 
 
383 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  29.66 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  30.2 
 
 
392 aa  170  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.91 
 
 
383 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  28.65 
 
 
382 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  31.4 
 
 
390 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  31.23 
 
 
386 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  30.39 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  30.16 
 
 
376 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  28.31 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.13 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.9 
 
 
421 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  28.23 
 
 
378 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.05 
 
 
406 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 
412 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  28.82 
 
 
429 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.32 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.23 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.53 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  29.85 
 
 
665 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.59 
 
 
605 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.03 
 
 
644 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.17 
 
 
572 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  29.35 
 
 
422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  28.24 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  28.24 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.09 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.51 
 
 
393 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  28.5 
 
 
401 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.2 
 
 
420 aa  127  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.97 
 
 
608 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.53 
 
 
630 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  28.24 
 
 
401 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.63 
 
 
425 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.72 
 
 
435 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.84 
 
 
885 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.32 
 
 
392 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.72 
 
 
418 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.82 
 
 
880 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.53 
 
 
415 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.53 
 
 
433 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 
416 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.18 
 
 
434 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.79 
 
 
404 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.32 
 
 
409 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  29.46 
 
 
416 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.8 
 
 
560 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.16 
 
 
414 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.09 
 
 
406 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.82 
 
 
417 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  27.54 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  29.92 
 
 
688 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.34 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.84 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.98 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.27 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.32 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  29.4 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.13 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.17 
 
 
415 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>