More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0298 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  100 
 
 		 383 aa  775    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  55.91 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  53.72 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  47.21 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  38.7 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  38.9 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  36.81 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  37.53 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  36.55 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.6 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  33.25 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  35.92 
 
 		 398 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  37.99 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  39.32 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  34.56 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  33.25 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  33.42 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  36.36 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  39.78 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  34.12 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  36.81 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  35.43 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  34.65 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  34.56 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  33.76 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  36.48 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  36.9 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  35.62 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  37.47 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  32.81 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  37.56 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  35.94 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  33.77 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  36.18 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  35.73 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  35.34 
 
 		 392 aa  192  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  36.08 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  34.47 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  33.77 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.07 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  35.91 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  31.85 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.36 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.75 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.81 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  28.98 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.26 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  30.33 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.69 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.65 
 
 		 879 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  29.85 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  29.02 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.48 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.75 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.72 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.67 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2430  Cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0300543  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  26.15 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.9 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  27.46 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.77 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.36 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.83 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  30.08 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.56 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.92 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 		 406 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.84 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.62 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.11 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.84 
 
 		 604 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.02 
 
 		 673 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  28.81 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.94 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  29.13 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  30.08 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.97 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.31 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.53 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 		 644 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.49 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  28.86 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.03 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  28.25 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.81 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 641 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.51 
 
 		 885 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  28.37 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  30.03 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>