More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2430 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2430  Cysteine desulfurase  100 
 
 
372 aa  762    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0300543  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  37.07 
 
 
376 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  31.2 
 
 
381 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  32.27 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  33.51 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  34.55 
 
 
381 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  33.07 
 
 
386 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  32.81 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  34.04 
 
 
385 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  32.45 
 
 
384 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  32.29 
 
 
382 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  35.01 
 
 
379 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  30.32 
 
 
385 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.72 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  32.2 
 
 
380 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  32.01 
 
 
380 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  31.62 
 
 
388 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  30.16 
 
 
380 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  30.97 
 
 
387 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  29.92 
 
 
381 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  29.97 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  30.59 
 
 
383 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.2 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  30.48 
 
 
381 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  30.79 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  31.01 
 
 
398 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  31.84 
 
 
382 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  29.47 
 
 
400 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  30.55 
 
 
390 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
388 aa  159  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  30.91 
 
 
376 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  29.68 
 
 
380 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.27 
 
 
385 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  28.83 
 
 
392 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  33.25 
 
 
381 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  30.87 
 
 
382 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  31.18 
 
 
413 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.24 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  29.02 
 
 
378 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  28.46 
 
 
383 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  31.59 
 
 
394 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  29.87 
 
 
378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  30.13 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  28.68 
 
 
394 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  31.52 
 
 
412 aa  142  8e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  30.16 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.66 
 
 
408 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  29.69 
 
 
399 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.06 
 
 
408 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.76 
 
 
393 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.89 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  29.08 
 
 
569 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.68 
 
 
413 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  27.35 
 
 
386 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.97 
 
 
885 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.69 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  28.05 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.08 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.35 
 
 
572 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  30.17 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  30.26 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  28.2 
 
 
393 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  29.74 
 
 
401 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  29.74 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  29.74 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  29.74 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  29.74 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  30.26 
 
 
401 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.82 
 
 
878 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.9 
 
 
430 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.05 
 
 
896 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  29.11 
 
 
430 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.98 
 
 
417 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  29.41 
 
 
401 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 
412 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  29.41 
 
 
401 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.65 
 
 
418 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  29.72 
 
 
401 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.94 
 
 
414 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  29.49 
 
 
401 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30.18 
 
 
880 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.35 
 
 
879 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  29.44 
 
 
401 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  29.44 
 
 
401 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  28.02 
 
 
401 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  28.21 
 
 
401 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  27.32 
 
 
401 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.23 
 
 
413 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  31.5 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  28.27 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  29.97 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.5 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.01 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.58 
 
 
437 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  28.57 
 
 
405 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  28.57 
 
 
405 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.92 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.13 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  29.74 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>