More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0967 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  100 
 
 		 399 aa  821    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  46 
 
 		 401 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  46.25 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  45.89 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  45.89 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  45.89 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  45.89 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  45.89 
 
 		 401 aa  348  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  45.64 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  45.39 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  45.14 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  45.14 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  45.89 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  47.13 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  45.64 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  45.64 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  45 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  46.08 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  46 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  46 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  45.75 
 
 		 401 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  45.75 
 
 		 401 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  45.75 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  43.25 
 
 		 401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  41.06 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.16 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  38.77 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  41.04 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.04 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  41.1 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  38.86 
 
 		 403 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  41.1 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  40.8 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  42.57 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.95 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.29 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.67 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  41.04 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.95 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.7 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.95 
 
 		 437 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  40.3 
 
 		 401 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  37.84 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  40.05 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  40.66 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  37.84 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.5 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  40.05 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  40.05 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  40.05 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  37.31 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  40.05 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  40.05 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39100  cysteine desulfurase, sufS  42.41 
 
 		 449 aa  292  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0233253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  39.11 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.7 
 
 		 672 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.7 
 
 		 674 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  40.35 
 
 		 415 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.16 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  40.6 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3181  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.65 
 
 		 420 aa  289  7e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  40.35 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  41 
 
 		 572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  39.85 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  40.74 
 
 		 412 aa  285  9e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.13 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0808  cysteine desulfurase  40.6 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.4 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40 
 
 		 569 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 404 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  37.34 
 
 		 661 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0753  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  38.25 
 
 		 419 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  37.41 
 
 		 688 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.93 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  39.85 
 
 		 403 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.94 
 
 		 664 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.67 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.25 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.44 
 
 		 673 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  38.08 
 
 		 417 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.59 
 
 		 408 aa  279  8e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.31 
 
 		 650 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  37.06 
 
 		 682 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.86 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.06 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>