More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3807 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 
401 aa  814    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  74.31 
 
 
401 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  72.57 
 
 
401 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  72.82 
 
 
401 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  72.57 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  73.32 
 
 
401 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  72.82 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  72.32 
 
 
401 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  72.32 
 
 
401 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  72.32 
 
 
401 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  72.32 
 
 
401 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  71.82 
 
 
401 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  71.82 
 
 
401 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  71.82 
 
 
401 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  71.82 
 
 
401 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  71.57 
 
 
401 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  70.82 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  66.33 
 
 
401 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  52.64 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  51.24 
 
 
403 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  49.38 
 
 
405 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  49.75 
 
 
403 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.12 
 
 
417 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.57 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.47 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.47 
 
 
404 aa  352  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.52 
 
 
417 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  45.57 
 
 
414 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.6 
 
 
407 aa  348  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.53 
 
 
419 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.68 
 
 
427 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.28 
 
 
419 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.97 
 
 
451 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  44.75 
 
 
425 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.84 
 
 
407 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  47.13 
 
 
399 aa  344  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.85 
 
 
406 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.04 
 
 
408 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.69 
 
 
420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  44.64 
 
 
420 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.98 
 
 
406 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.08 
 
 
413 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.84 
 
 
406 aa  342  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  42.07 
 
 
569 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.6 
 
 
406 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.31 
 
 
413 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  45.21 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.79 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.59 
 
 
406 aa  338  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.59 
 
 
406 aa  338  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.35 
 
 
406 aa  338  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.31 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  47.03 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  44 
 
 
572 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  43.46 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  45.3 
 
 
405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.09 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.2 
 
 
416 aa  336  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  45.59 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  45.59 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.59 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  45.43 
 
 
413 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.56 
 
 
413 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.81 
 
 
429 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.81 
 
 
429 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.09 
 
 
406 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.34 
 
 
406 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.34 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.32 
 
 
414 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.6 
 
 
404 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.22 
 
 
412 aa  333  4e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.11 
 
 
664 aa  332  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.85 
 
 
413 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.9 
 
 
408 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
417 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.96 
 
 
408 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.97 
 
 
674 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.4 
 
 
414 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.97 
 
 
672 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.18 
 
 
413 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.61 
 
 
413 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.93 
 
 
429 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.65 
 
 
412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.15 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  41.19 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.15 
 
 
406 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.11 
 
 
406 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.15 
 
 
406 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.15 
 
 
406 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  41.19 
 
 
405 aa  328  9e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.18 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.9 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.11 
 
 
673 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  41.22 
 
 
414 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>