More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1932 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 380 aa  756    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  94.99 
 
 		 380 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  62.37 
 
 		 380 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  61.21 
 
 		 381 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  62.6 
 
 		 380 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  55.58 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  54.01 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  52.63 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  52.23 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  50 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  46.83 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  45.77 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  48.94 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  47.62 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  45.6 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  43.95 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  47.89 
 
 		 381 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  42.71 
 
 		 381 aa  342  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  44.27 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  50.93 
 
 		 383 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  39.16 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.9 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  42.29 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  44.27 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  43.39 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  42.33 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  43.09 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  41.27 
 
 		 380 aa  296  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  37.37 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  39.31 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  44.14 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  39.73 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  41 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  34.3 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  36.98 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  35.73 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  39.15 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  37.7 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  36.26 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.87 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  36.22 
 
 		 879 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.09 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 880 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 896 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 878 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  36.05 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  36.7 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  35.43 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.86 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.5 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.55 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.29 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.81 
 
 		 885 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.27 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  37.63 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  34.99 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.25 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.22 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.76 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.85 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.91 
 
 		 415 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.72 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.68 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  33.77 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.38 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.9 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.65 
 
 		 419 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.76 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  29.82 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.41 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.88 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.19 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.51 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.57 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  32.83 
 
 		 423 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 408 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  32.99 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.25 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  32.64 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  35.14 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.97 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.85 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.85 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.58 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.52 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  33.84 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  30.99 
 
 		 413 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.9 
 
 		 417 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.98 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 		 429 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.04 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>