More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0679 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  782    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  47.77 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  49.47 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  47.24 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  43.98 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  41.78 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  41.78 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  39.58 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.9 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  39.95 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  37.06 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.48 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  39.27 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  41.21 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  38.22 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  38.58 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  37.34 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  36.24 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  37.8 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  38.12 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  35.87 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  37.01 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  35.98 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  36.68 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  34.3 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  37.08 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  36.01 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  33.95 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  36.65 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  36.18 
 
 		 398 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  37.8 
 
 		 383 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  36.79 
 
 		 380 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.92 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  33.59 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  33.25 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  34.38 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  37.92 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.51 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.56 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.51 
 
 		 885 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.01 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 678 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.87 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.13 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.28 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.43 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.88 
 
 		 879 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.79 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.63 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.24 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.05 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.36 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  31.2 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  30.38 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.67 
 
 		 878 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  30.51 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.79 
 
 		 429 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 630 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  29.24 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.12 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.43 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30.41 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  30.89 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  30.33 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.5 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.11 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.88 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.17 
 
 		 880 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.06 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.85 
 
 		 418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  29.16 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.05 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  31.3 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 657 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 		 608 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  31.13 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.39 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.9 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.1 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.58 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.12 
 
 		 662 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>