More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2195 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  100 
 
 		 390 aa  785    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  39.68 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  39.11 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  40.7 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  35.26 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  31.33 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  32.56 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  32.56 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  32.56 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  32.56 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  31.28 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  32.31 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  31.89 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  30.33 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  32.31 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  33.16 
 
 		 419 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 684 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.14 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.94 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  27.76 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  30.72 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  26.33 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  23.31 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  28.64 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  25.32 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25.86 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.59 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.95 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.59 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  24.79 
 
 		 461 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  31.44 
 
 		 437 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  22.57 
 
 		 462 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.85 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  23.32 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  33.62 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.45 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  23.51 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  21.47 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.66 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  23.61 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  25.08 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  27.73 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  22.57 
 
 		 429 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.05 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  24.76 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.3 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  24.08 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  23.34 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  23.79 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.1 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  22.73 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  23.54 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.74 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.1 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  26.69 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.29 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  25.55 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  25.44 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  26.25 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.65 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  25.38 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25.08 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  25.1 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  25.49 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  25.77 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  25.98 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.3 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.3 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  22.47 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.72 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.9 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  22.82 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.39 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  21.47 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  22.82 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 880 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  25.26 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  19.91 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  28.15 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  22.44 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.73 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  19.48 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.85 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  27 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  19.48 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.48 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  27.44 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.12 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  21.78 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>