More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3348 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  100 
 
 
415 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  56.49 
 
 
392 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  55.67 
 
 
404 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  55.16 
 
 
401 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  54.68 
 
 
395 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  54.43 
 
 
395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  51.14 
 
 
387 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  38.65 
 
 
400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  38.4 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  42.86 
 
 
400 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  40.1 
 
 
391 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  40.85 
 
 
428 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  42.75 
 
 
388 aa  296  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  35.11 
 
 
391 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  35.37 
 
 
391 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  34.86 
 
 
390 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  34.86 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  32.4 
 
 
367 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.88 
 
 
374 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.9 
 
 
372 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  33.01 
 
 
287 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  30.07 
 
 
387 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.94 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.85 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  33.33 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.65 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.94 
 
 
401 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  29.67 
 
 
376 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  27.25 
 
 
380 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  25.72 
 
 
403 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24.88 
 
 
438 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.57 
 
 
437 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.16 
 
 
414 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.76 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.41 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  33.09 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.91 
 
 
414 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.04 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  30.28 
 
 
383 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  30.03 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.12 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.01 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.48 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.57 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.81 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.09 
 
 
416 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
392 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.25 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  31.76 
 
 
389 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.05 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.32 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.07 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.03 
 
 
377 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.51 
 
 
413 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.86 
 
 
413 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  31.03 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  27.98 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  27.72 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.65 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.21 
 
 
430 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.72 
 
 
406 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  32.04 
 
 
378 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.75 
 
 
399 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.47 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.43 
 
 
376 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  28.12 
 
 
394 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  24.09 
 
 
414 aa  109  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.47 
 
 
419 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.01 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.87 
 
 
414 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  29.8 
 
 
407 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.48 
 
 
401 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  26.61 
 
 
394 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.98 
 
 
418 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.6 
 
 
379 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.38 
 
 
413 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.74 
 
 
418 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  26.23 
 
 
406 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.56 
 
 
428 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  27.2 
 
 
392 aa  106  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  32.14 
 
 
381 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  31.08 
 
 
373 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  27.87 
 
 
430 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.41 
 
 
412 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.7 
 
 
406 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  26.04 
 
 
406 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.74 
 
 
377 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  29.82 
 
 
385 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  29.18 
 
 
380 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.89 
 
 
391 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  28.72 
 
 
413 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  23.8 
 
 
393 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.42 
 
 
880 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  25.92 
 
 
377 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  25.84 
 
 
390 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  30.86 
 
 
377 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.31 
 
 
426 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.72 
 
 
414 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.02 
 
 
415 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.72 
 
 
414 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>