More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00480 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1429    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.3 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  29.09 
 
 		 421 aa  203  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  31.32 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  28.79 
 
 		 407 aa  160  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  28.54 
 
 		 389 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  27.8 
 
 		 419 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  27.55 
 
 		 384 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 390 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  28.09 
 
 		 388 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25.93 
 
 		 399 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  29 
 
 		 390 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  25.73 
 
 		 464 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  25.73 
 
 		 385 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  25.73 
 
 		 385 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  25.73 
 
 		 385 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  25.49 
 
 		 385 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  25.49 
 
 		 385 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  23.35 
 
 		 388 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  29.05 
 
 		 469 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  24.32 
 
 		 485 aa  97.4  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 476 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  22.26 
 
 		 437 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  22.51 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  21.72 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  22.57 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  23.72 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.03 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  23.49 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  21.61 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  23.98 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  25.19 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08193  disease resistance protein Aig2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03210)  27.98 
 
 		 224 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.38 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  24.38 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  24.72 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  21.69 
 
 		 399 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  22.57 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  22.86 
 
 		 426 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  20.67 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  26.86 
 
 		 420 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  24.06 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.76 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  25.1 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.2 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  22.47 
 
 		 394 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  24.64 
 
 		 395 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  21.58 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  26.46 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  23.4 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  21 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  23.26 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  19 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  22.25 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.35 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  24.35 
 
 		 879 aa  64.3  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  23.73 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  23.18 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  23.03 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  23.03 
 
 		 395 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  25.39 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  22.79 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.55 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.2 
 
 		 885 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  22.69 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  22.06 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  25 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  21.74 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  22.04 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  24.6 
 
 		 387 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  21.14 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.4 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  19.48 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  45.16 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  23.44 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.82 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.14 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  21.74 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  19.75 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  27.78 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  23.85 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.75 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  20 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  22.33 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.75 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  28 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  23.21 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  27.05 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.4 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.14 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.59 
 
 		 626 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  22.08 
 
 		 407 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  21.85 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  22.03 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>