More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64026 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  100 
 
 		 421 aa  872    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  50.12 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.9 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 684 aa  203  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  27.86 
 
 		 389 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 384 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  25.12 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  26.14 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  26.5 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  23.77 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  25.75 
 
 		 385 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  25.73 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  21.76 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  22.57 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.66 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  26.97 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  23.1 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  22.97 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  25.21 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.48 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.71 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24.1 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.37 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  24.39 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  22.56 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  21.92 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  23.08 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  22.65 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  21.28 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  27.89 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  21.36 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  23.88 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  20.85 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.85 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  22.26 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  21.5 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.4 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  21.25 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  28.74 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.78 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.07 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.46 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  21.12 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  22.48 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  24.32 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  26.7 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.06 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  23.03 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  23.65 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.43 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  23.48 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  17.74 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  25.4 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  22.05 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  20.87 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  21.96 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  25.6 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  23.02 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  23.43 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  21.92 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  21.45 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  24.05 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.64 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  26.75 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  24.39 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  19.88 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  22.37 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  19.48 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  25.86 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  36.59 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  20.57 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  21.12 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  22.02 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  22 
 
 		 880 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  20.49 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  24.8 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  19.35 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  22.86 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.95 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  23.33 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  33.77 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  21.39 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  20.68 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.97 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.64 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.14 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>