More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3723 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  100 
 
 
372 aa  746    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  65.5 
 
 
379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  57.68 
 
 
374 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  52.89 
 
 
367 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  29.4 
 
 
404 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.03 
 
 
368 aa  169  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  30.67 
 
 
401 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  29.55 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  29.55 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  27.08 
 
 
376 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  29.06 
 
 
392 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.46 
 
 
387 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.98 
 
 
393 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  32.72 
 
 
394 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.01 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  39.8 
 
 
287 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  31 
 
 
412 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  30.3 
 
 
394 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  28.9 
 
 
415 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  32.2 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  30.51 
 
 
392 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30.73 
 
 
379 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.94 
 
 
381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.86 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.89 
 
 
878 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.15 
 
 
885 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.05 
 
 
880 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  30.15 
 
 
393 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
418 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  28.94 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  30.69 
 
 
394 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  28.9 
 
 
400 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  27.37 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.07 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  31.6 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 
644 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.07 
 
 
414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.65 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  30.1 
 
 
896 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.15 
 
 
419 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.7 
 
 
408 aa  133  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.44 
 
 
421 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.15 
 
 
414 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.85 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  29.1 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.7 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.82 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
381 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.76 
 
 
433 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.77 
 
 
414 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  28.86 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.99 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.58 
 
 
435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.6 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.16 
 
 
415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  28.57 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  28.28 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28.43 
 
 
430 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  28.43 
 
 
406 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.73 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.17 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.43 
 
 
406 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.55 
 
 
414 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.8 
 
 
378 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 
414 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.2 
 
 
377 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  26.98 
 
 
495 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.25 
 
 
417 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 
417 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.6 
 
 
387 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 
417 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.96 
 
 
449 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.39 
 
 
879 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.01 
 
 
421 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  30.47 
 
 
403 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.99 
 
 
425 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  26.8 
 
 
400 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  27.37 
 
 
428 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  28.24 
 
 
665 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  28.61 
 
 
476 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.28 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.36 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.3 
 
 
560 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  26.8 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.39 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.54 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.29 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.54 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  26.07 
 
 
410 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  26.01 
 
 
416 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  28.21 
 
 
393 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.2 
 
 
407 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.35 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.19 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.87 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.04 
 
 
657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>