More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1586 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 		 400 aa  818    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  72.28 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  68.54 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  58.07 
 
 		 391 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  56.56 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  56.3 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  44.44 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  43.81 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  42.78 
 
 		 390 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  43.67 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  42.15 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  41.15 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  41.65 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  41.09 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.35 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.13 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.9 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  33.65 
 
 		 287 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.07 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.59 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.63 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.04 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  24.87 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.68 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.46 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.92 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  30.6 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.48 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.07 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  28.62 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.02 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.62 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.62 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.79 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  23.15 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  25.82 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.95 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.84 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.18 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.3 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  28.35 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.64 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.17 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.11 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.73 
 
 		 426 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.4 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.72 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.77 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.43 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.72 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.59 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.87 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.24 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.44 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  28.33 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  22.85 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  23.64 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  23.64 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  23.64 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  28.21 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.4 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  24.18 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  24.18 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.57 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.44 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  23.75 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  26.27 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.11 
 
 		 415 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  29.35 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.24 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  25.43 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.07 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.14 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.04 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  30.22 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  26.34 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.88 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  22.86 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.21 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.38 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.18 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.88 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  20.53 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.88 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.78 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  23.94 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.32 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>