More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1866 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  790    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  37.93 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  38.13 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  35.58 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  35.91 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  32.8 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  35.34 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  34.33 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  34.83 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  35.81 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  35.2 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  34.31 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  31.77 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  33.6 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  30.45 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  35.39 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.89 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  34.71 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  31.47 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  31.15 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  31.86 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  28.76 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.9 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  30.07 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  30.2 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  31.54 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  28.24 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.06 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  30.71 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  30.47 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  30.97 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.07 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.92 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  28.46 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  28.27 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  30.33 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.78 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.32 
 
 		 880 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  28.36 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.57 
 
 		 885 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  31.27 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.15 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  30.13 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  25.89 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  29.32 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  31.99 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  28.52 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.61 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  31.23 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  28.27 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  26.26 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  27.94 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  27.55 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.99 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.32 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  29.61 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.83 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  25.54 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.43 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  29.02 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.53 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.33 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  28.91 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  28.54 
 
 		 878 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  26.04 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.81 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  26.32 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  28.19 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.49 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  28.35 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  27.56 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  27.51 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  25.79 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  28.02 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  29.04 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.65 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  31.29 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  26.22 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  28.89 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  25.65 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  29.38 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 641 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.49 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  31.44 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.3 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  28.35 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>