More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0791 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 
388 aa  787    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  72.28 
 
 
400 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  68.54 
 
 
428 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  59.59 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  55.64 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  54.96 
 
 
400 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  45.36 
 
 
391 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  45.36 
 
 
391 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  44.85 
 
 
390 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  45.1 
 
 
391 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  41.9 
 
 
392 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  42.27 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  42.27 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  42.42 
 
 
415 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  41.9 
 
 
387 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  39.64 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  39.12 
 
 
401 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.94 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.29 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  30.67 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  33.44 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.06 
 
 
379 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.75 
 
 
381 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  29.16 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.91 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  25.5 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.21 
 
 
413 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.42 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  25.62 
 
 
393 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.41 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  30.83 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.63 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.01 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  27.6 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.65 
 
 
412 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.38 
 
 
378 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.51 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  24.94 
 
 
476 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.71 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.78 
 
 
437 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  30 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  25.8 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  24.94 
 
 
461 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.91 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.52 
 
 
413 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  29.32 
 
 
381 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.52 
 
 
413 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.1 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.44 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  26.94 
 
 
393 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  32.33 
 
 
419 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  24.5 
 
 
462 aa  86.3  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  23.11 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.35 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.38 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.3 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  29.21 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  21.73 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.04 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  23.33 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.87 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.45 
 
 
896 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  24.09 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  26.63 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.27 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  30.7 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  28.91 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  23.79 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  29.43 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.22 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.34 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.89 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  28.87 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.32 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  24.88 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  29.36 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.51 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.24 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  28.21 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  23.81 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.53 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  27.21 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  26.32 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  27.02 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25.92 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  29.24 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  22.94 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  25.36 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.71 
 
 
678 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.63 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.64 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  22.52 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  27.43 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  25.73 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.16 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  30.22 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.92 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.92 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.92 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  28.26 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>