More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1071 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  771    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  64.88 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  66.49 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  34.05 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  31.23 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.15 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.87 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.82 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.53 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.95 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  30.18 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  30.16 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  30.24 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.58 
 
 		 880 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  29.77 
 
 		 429 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.71 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  32.53 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.86 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  29.36 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.75 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.31 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.05 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.59 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.91 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  29.07 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.48 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  32.85 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.75 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.67 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.2 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.38 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.29 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.45 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  28.44 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.67 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.62 
 
 		 421 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.38 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.22 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  30.03 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.81 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.72 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  28.69 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.54 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.42 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.17 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.5 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.43 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  27.85 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.85 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  28.84 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  29.35 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.23 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  26.57 
 
 		 879 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  25.15 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.88 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.21 
 
 		 416 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.18 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.49 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.6 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.14 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.66 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.23 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  25 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 425 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.49 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.5 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.93 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.5 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  27.65 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  29.34 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.35 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  29.77 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  26.93 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.06 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>