More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0692 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 464 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 385 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  99.74 
 
 		 385 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  99.48 
 
 		 385 aa  785    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 385 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 385 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  47.85 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  48.2 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  48.97 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  34.97 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  35.44 
 
 		 419 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  33.85 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  28.31 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  30.1 
 
 		 470 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  26.52 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.53 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.83 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.36 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 684 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  31.38 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.83 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  23.17 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  26.24 
 
 		 462 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  25.85 
 
 		 485 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  28.88 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  25.5 
 
 		 488 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  26.41 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.16 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.91 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  24.5 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.78 
 
 		 445 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.51 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  26.4 
 
 		 426 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  22.07 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.67 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.55 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  32.62 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.25 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  28.87 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.5 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.06 
 
 		 885 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  27.34 
 
 		 437 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.39 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.97 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.87 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.41 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.09 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.79 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.5 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  28.81 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.18 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.75 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  26.43 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.86 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.94 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.17 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.22 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  29.17 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.75 
 
 		 419 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.4 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.15 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  26.88 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  22.68 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.4 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.7 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 426 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 		 413 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  24.19 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  22.71 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.15 
 
 		 406 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.6 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.56 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.64 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.02 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.15 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.38 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.15 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.56 
 
 		 657 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.03 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.94 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.72 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.69 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  22.7 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  25.97 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>